Automatisches Netzrouting
Das Routing der Netze dient dem Ermitteln optimaler Netzlinien für die Verbindungen zwischen den Pins der verwendeten Komponenten. Die Netze, die Energie- oder Stoffströme darstellen, bestehen aus Linien, die ausschließlich vertikal oder horizontal verlaufen.
Sofort nachdem die Pins per Drag-and-Drop miteinander verbunden wurden, erfolgt das Routing der Netze automatisch. Dazu sollte zwischen den Komponenten ausreichend Platz gelassen werden. Ist dies nicht der Fall, erfolgt ein Notrouting. Dabei kann eine Verbindungslinie durch Komponenten direkt hindurch geführt werden, eine Darstellung, die sonst nicht vorkommt. Dies hat zwar keine Folgen für die Simulationsergebnisse, erschwert aber die visuelle Analyse des Systems.
Der Abstand zwischen den Komponenten sollte mindestens so groß sein, dass sich die Netzlinien nicht mit den Komponenten überschneiden.
Das Routing der Netze ist grundsätzlich automatisiert. Es ist jedoch auch möglich, einzelne markierte Netzabschnitte per Drag-and-Drop manuell zu platzieren.
Die Verbindungen werden sofort aktualisiert, wenn eine Komponente bewegt wird. Auch wenn eine Komponente gedreht oder gespiegelt wird, aktualisieren sich die Netzverbindungen automatisch.
Durch leichte Verschiebungen einer Komponente kann die Neuausrichtung der Netzverbindung angeregt werden. Sollte das Ergebnis nicht zufriedenstellend sein, aktivieren Sie 
Globales Layout in der Gruppe Layout des Schema-Ribbons, um die Netze erneut zu berechnen (siehe folgende Abbildung).
Die Möglichkeiten der Sankey-Darstellung der Massen-, Energie- und Exergieströme und das Aus- und Einblenden aller oder einzelner Netze werden in den beiden verlinkten Artikeln vorgestellt.
Klickt man auf dem Schema mit der rechten Maustaste auf eine Netzverbindung, erhält man das folgende Kontextmenü, mit dem sich der gewählte 
Netzabschnitt neu routen, der Stoffwert ändern und der Netzabschnitt 
Löschen lassen.
Stoffwerte ändern
In dem oben abgebildeten Kontextmenü des Netzes lässt sich unter Stoffwert ändern die folgende Liste öffnen, aus der man dem Netz ein neues Stoffmodell zuordnen kann. Damit werden auch die zu dem Netz gehörenden Pins an den Komponenten ersetzt.
In der Regel muss hier aber keine manuelle Einstellung erfolgen. TOP-Energy wählt den passenden Stoffwert anhand der verwendeten Anlage automatisch aus.
Ebenen ausblenden
Die Netze der einzelnen Stoffmodelle sind auf verschiedenen Ebenen angeordnet, die sich einzeln oder gemeinsam ein- und ausblenden lassen (siehe folgende Abbildung und den verlinkten Artikel).
